07. Statistics(ANOVA)
07. Statistics(ANOVA)
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통계학 실습
석회황이 벌에게 미치는 효과 분산분석 보고서
R의 OrchardSprays는 8가지 농도(A > B > … > H)의 석회황유화액(lime surphur emulsion)을 자당 용액(sucrose solution)에 섞은 후, 농도별로 8개의 벌 방에 발랐다. 여기에 100마리 벌을 넣은 후 2시간 뒤, 각 벌 방에서 줄어든 자당 용액의 양을 측정하였다.
그림 1은 농도별 자당 감소량의 상자도표(boxplot)이며, 표 1은 각 농도별 자당 감소량의 평균과 표준편차 등을 요약한 기술통계 표이다.
또한 일원분산분석(ANOVA)을 이용하여 석회황 농도에 따라 자당 감소량이 유의미하게 달라지는지를 확인하고, 사후 분석으로 던컨의 다중비교법(여기서는 Tukey HSD 대체)을 사용하여 농도 간 차이를 비교하였다. 유의수준은 0.05로 설정하였다.
그림 1. 농도별 자당 감소량 boxplot
표 1. 석회황 농도별 자당 감소액의 기술통계
농도 | 평균 | 표준편차 | 반복수 | 최소 | 최대 |
---|---|---|---|---|---|
A | 4.625 | 3.204 | 8 | 2 | 12 |
B | 7.625 | 3.292 | 8 | 4 | 14 |
C | 25.250 | 24.429 | 8 | 9 | 84 |
D | 35.000 | 13.438 | 8 | 20 | 57 |
E | 63.125 | 26.910 | 8 | 39 | 114 |
F | 69.000 | 29.189 | 8 | 20 | 114 |
G | 68.500 | 20.142 | 8 | 24 | 92 |
H | 90.250 | 24.224 | 8 | 69 | 130 |
그림 2. 일원분산분석 결과 (ANOVA Table)
- 유의확률 p = 9.499e-13 이므로, 농도에 따른 자당 감소 효과는 동일하지 않다 (통계적으로 유의미한 차이가 존재).
그림 3. 던컨 다중비교 (Tukey HSD 결과)
- Tukey HSD 결과에 따르면:
- 농도 F, G, E는 동일 그룹으로 묶인다.
- 농도 A, B는 동일 그룹이며 가장 감소량이 작다.
- 농도 H는 유의하게 가장 높은 감소량을 보인다.
부록
Boxplot 코드
1
boxplot(decrease ~ treatment, data = OrchardSprays)
ANOVA 수행 코드
1
2
fit <- lm(decrease ~ treatment, data = OrchardSprays)
anova(fit)
ANOVA 콘솔 출력
1
2
3
4
5
6
7
8
Analysis of Variance Table
Response: decrease
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
treatment 7 56160 8022.9 19.062 9.499e-13 ***
Residuals 56 23570 420.9
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Duncan 다중비교 (Tukey HSD 대체) 코드
1
2
3
install.packages("agricolae")
library(agricolae)
duncan.test(fit, "treatment", alpha = 0.05, console = TRUE)
Duncan 다중비교 콘솔 출력 요약((Tukey HSD 결과)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
decrease groups
H 90.250 a
F 69.000 b
G 68.500 b
E 63.125 b
D 35.000 c
C 25.250 cd
B 7.625 d
A 4.625 d
End